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　　本研究针对生成式AI(genAI)实际应用效果缺乏全球尺度量化数据的难题，开发了基于GraphCodeBert的神经网络分类器，对六国30余万开发者的3000万次代码提交进行分析。结果显示：截至2024年底，美国29%的Python函数为AI生成，生产力提升3.6%，但收益集中分布于资深开发者，早期从业者未见显著获益，这可能加剧软件开发领域的技能分化。

　　5500年前哥伦比亚Treponema pallidum古基因组揭示梅毒螺旋体美洲深时演化新支系

　　编辑荐读：为弥合骨骼病理与分子记录之间的千年断层，作者对哥伦比亚Tequendama I岩棚一具无骨病迹象的中全新世人骨进行宏基因组筛查，重建出1.7×覆盖度的T. pallidum古基因组TE1-3；系统发育将其定位为现存全部T. pallidum亚种的早期姊妹支系，分歧时间约13.7 ka，把美洲梅毒螺旋体基因组记录前推3 ka，为评估毒力基因保守性与前哥伦布时期疾病多样性提供罕见校准点。

　　内源性逆转录病毒MLT2A1通过合成嵌合RNA与HNRNPU结合招募RNA聚合酶II，形成自增强网络促进人类受精卵基因组激活（ZGA），其功能缺失导致胚胎发育停滞，为辅助生殖医学提供新靶点。

　　血小板αIIbβ3整合素在COVID-19和脓毒症中通过形成PITTs促进凝血炎症平衡紊乱，其缺失导致止血功能受损。PITTs锚定白细胞和内皮细胞加剧炎症，阻断αIIbβ3可改善组织损伤和预后。

　　本综述通过单细胞核RNA测序、空间转录组学及蛋白质组学技术，系统描绘了COPD肺部细胞群落动态变化，揭示了疾病异质性背后的关键细胞状态（如炎症非免疫细胞、异常基底样细胞ABCs）及其空间共定位特征，为靶向治疗提供了新视角。

　　来自马德里卡洛斯三世大学 (UC3M)、国家心血管研究中心 (CNIC) 和美国耶鲁大学的研究人员在《细胞》(Cell) 杂志上发表了一篇综述文章，提出了理解中性粒细胞（免疫系统中最丰富的细胞）的新框架。作者基于近期研究的大量证据，将中性粒细胞描述为一个动态且适应性强的群体，它们能够进行功能多样化并形成免疫记忆，远远超出了人们传统认知中的作用。

　　微单孢菌（Micromonospora echinospora）细胞工厂的系统工程改造，以实现庆大霉素C1a的过量生产

　　本研究通过基因组尺度代谢模型揭示黄连素C1a合成瓶颈，过表达关键基因genC、metK、BldD使产量提升34.3%，结合贝叶斯优化驱动的营养调控与原位吸附技术，在分批培养中实现964.1 mg/L的高效生产，验证了代谢工程优化在工业级生物制造中的可行性。

　　摘要A018：INPP4B下调及AKT1依赖性作为TMPRSS2:ERG融合前列腺癌中的新兴治疗靶点 免费

　　前列腺癌中TMPRSS2:ERG融合基因通过抑制PI3K/AKT通路，促使INPP4B磷酸酶下调以补偿AKT活性，形成AKT1依赖的替代信号通路，为AKT1特异性抑制剂ATA-001提供理论依据。

　　摘要A015：局部前列腺癌的表观遗传驱动因素揭示了神经元和微环境的重编程，并为液体活检生物标志物的研究提供了依据 免费

　　前列腺癌表观遗传驱动研究揭示肿瘤特异性DNA甲基化程序分化出两个进化亚型（ERG融合型与SPOP突变型），通过单细胞和空间转录组学解析了肿瘤微环境重塑机制，并建立液体活检生物标志物模型。甲基化图谱显示luminal细胞具有神经元样可塑性，而免疫/内皮细胞驱动ECM重构和血管生成。血浆cfDNA解离出肿瘤来源DNA和微环境来源DNA，后者可独立于肿瘤DNA预示疾病进展。

　　摘要A013：来自AACR GENIE队列的前列腺癌基因组预后生物标志物 免费

　　摘要A020：液态活检在转移性去势抵抗性前列腺癌（mCRPC）中的应用：患者特征、治疗选择及突变状态 免费

　　转移性去势抵抗性前列腺癌（mCRPC）患者液体活检ctDNA检测后，靶向治疗使用率显著提升，且携带特定基因突变（如AR扩增、EGFR扩增、AR p.L702H）与较差的无进展生存期相关，而ctDNA总负荷（MAF）对生存预测更具优势。研究基于真实世界数据，验证了ctDNA在指导精准治疗和生物标志物筛选中的应用价值。

　　摘要A016：前列腺癌来源的细胞外囊泡可重新编程骨微环境细胞，从而促进单核细胞的迁移 免费

　　前列腺癌（PCa）外泌体通过重编程骨微环境细胞促进单核细胞迁移，机制非直接化学趋化，未来将探索患者来源外泌体模型以开发监测和干预策略。

　　摘要A011：前列腺癌中AR共激活因子CBP/p300与免疫调节之间的相互作用 免费

　　前列腺癌（PCa）中CBP/p300抑制通过调控AR/MYC信号通路和IL-2/STAT、TNFα/NF-κB等炎症通路，改善肿瘤微环境免疫调控。研究显示抑制CBP/p300可降低PCa细胞增殖并增强T细胞功能相关分子表达，为联合治疗提供新思路。

　　中期因子（MDK）在肿瘤微环境中的多效性作用：从分子机制到免疫代谢重编程的治疗前景

　　本文综述了中期因子（MDK）这一癌胚细胞因子在肿瘤发生发展中的核心作用。研究人员系统阐述了MDK如何通过协调肿瘤细胞内在信号传导与微环境重塑，驱动免疫抑制、血管生成及治疗抵抗。研究结果表明，靶向MDK信号轴有望成为改善癌症免疫治疗应答和逆转耐药的新策略，具有重要的转化医学意义。

　　通过HMSNs（血管内皮祖细胞）实现时空精确调控的VEGF/IL-4递送，可促进无细胞血管移植物中的内皮化过程及免疫介导的基质重塑

　　空间分区调控的免疫调节组织工程血管移植物促进内皮化和基质重塑（88%内皮覆盖，6个月无动脉瘤）

　　T细胞代谢通过重编程调控免疫应答与表观遗传，其功能状态与组织微环境密切相关，靶向代谢干预为自身免疫疾病治疗提供新方向。

　　系统性硬化症（SSc）患者胃肠道组织病理学特征系统回顾显示，纤维化并非普遍存在且分布不均，黏膜层以炎症浸润和绒毛萎缩为主，肌层普遍存在平滑肌萎缩及神经节细胞退化。研究强调标准化病理报告和超微结构研究对机制探索及治疗靶点开发的重要性。

　　为破解“地衣仅由真菌-藻类两极共生”的传统认知局限，研究团队对149份U.pustulata个体进行跨欧洲宏基因组测序，结合FISH-CLSM定位，发现黑真菌M.gundecimermaniae在100%样本中稳定存在，且可随isidia垂直传播。结果提示地衣应被视为“微型生态系统”，为阐明共生体装配规则与功能冗余提供新范式。

　　本研究通过训练大鼠识别不同场景中的列表气味，验证了大鼠能够同时记忆事件顺序和上下文，即使列表被打断或经历30分钟延迟，记忆仍保持 robust，表明大鼠可作为复杂认知过程的模型，为记忆机制、疾病及疗法研究提供新视角。

　　烷基链长度调控L-谷氨酸肽化学燃料驱动自组装动力学与纳米结构寿命的分子设计研究

　　本综述聚焦于化学燃料驱动短肽自组装体系的分子设计，揭示了烷基链长度对组装动力学与纳米结构寿命的精准调控机制。通过对比C3（丙基）与C6（己基）修饰的Z-封端短肽在EDC（1-乙基-3-(3-二甲氨丙基)碳二亚胺）燃料循环中的行为，阐明了烷基链长度通过调控疏水性、范德华力及β-片层氢键网络，分别诱导形成刚性棒状（C3）与动态纤维（C6）结构。研究结合高效液相色谱（HPLC）、核磁共振（1H NMR）、显微成像及分子动力学（MD）模拟，证明了短链促进致密有序组装体（延长催化寿命），长链增强溶剂可及性（加速水解），为设计时空可控的智能材料（如靶向药物递送、自适应催化）提供了新范式。